双方达成谅解协议并免于起诉的交通事故致人死

会留有案底。因交通事故致人死亡构成刑事犯罪，《刑法》规定需承担刑事责任，即便双方达成谅解，案底仍会留存。不及时处理可能影响个人信用及未来生活。
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常见处理方式为和解或走法律程序。若事故责任明确，双方可协商和解；若协商不成或责任不清，应通过法律程序解决，以确保权益。
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会留案底。操作如下：1.如双方已达成谅解，需确保协议内容合法有效，并留存证据；2.即便免于起诉，也应配合警方调查，了解案件进展；3.若涉及刑事责任，应咨询专业律师，了解可能面临的法律后果及应对措施。